Bien se préparer avant un test microbiote : l’essentiel à savoir

Le microbiote intestinal est un écosystème fragile : sa composition est fortement influencée par notre mode de vie et plus particulièrement notre alimentation.
Dans le cadre d’un test du microbiote, ce que vous mangez ou prenez les jours précédant votre prélèvement peut fortement impacter les résultats.

Bien se préparer est donc essentiel pour maximiser la qualité de l’échantillon, et rendre l’analyse la plus représentative possible. Dans cet article, découvrez ce qu’il faut faire (et éviter) avant de réaliser votre test du microbiote à domicile avec le kit d’analyse du microbiote intestinal Nahibu. Grâce à ce guide, vous optimiserez la fiabilité de votre bilan intestinal et vous vous assurerez que les résultats reflètent le véritable état de votre microbiote.

Pourquoi la préparation importe

Les tests du microbiote reposent essentiellement sur l’analyse d’un échantillon de selles à un instant T : il s’agit d’un “instantané” de votre flore intestinale.
Certains aliments, compléments ou médicaments peuvent modifier, à plus ou moins long terme, la composition du microbiote ou interférer directement avec l’analyse. Par exemple, les probiotiques, antibiotiques ou encore laxatifs peuvent altérer les résultats.
Ainsi, une préparation négligée peut nuire à la représentativité du test et rendre les recommandations nutritionnelles moins pertinentes.

Ce qu’il faut éviter avant le prélèvement

Voici les principaux pièges à éviter dans les jours (ou semaines) précédant votre test :

Antibiotiques, antifongiques, antiparasitaires

Le rôle des antibiotiques, antifongiques et antiparasitaires est d’éliminer les micro-organismes pathogènes responsables d’infections. Cependant, en ciblant ces agents infectieux, ils impactent inévitablement la flore commensale.
La prise d’antimicrobiens constitue ainsi un biais majeur dans l’analyse du microbiote. Il est donc préférable d’attendre un certain délai après un traitement avant de réaliser le prélèvement. Le microbiote met environ 2 à 3 mois pour retrouver un équilibre complet. Néanmoins, pour obtenir des résultats déjà représentatifs, un délai de 4 à 6 semaines après la fin d’un traitement est recommandé.

Usage de médicaments

De nombreux médicaments non-antimicrobiens peuvent aussi perturber le microbiote. C’est le cas de certains anti-inflammatoires (AINS), inhibiteurs de la pompe à protons (IPP), antidiabétiques (metformine), laxatifs, psychotropes…
Il est généralement recommandé d’attendre 2 à 3 semaines avant de réaliser le prélèvement.
Pour les traitements au long cours, n’arrêtez pas votre traitement sans avis médical.
La réalisation de lavements répétés peut également être agressive pour le microbiote. La encore, un délai d’au moins 4 semaines peut être nécessaire avant d’effectuer le test.

Probiotiques et prébiotiques

Les biotiques (probiotiques, prébiotiques, postbiotiques et symbiotiques) ont pour objectif de soutenir l’équilibre du microbiote en optimisant son écosystème. Leur consommation agit donc naturellement sur sa composition.
Si vous souhaitez connaître l’état de votre microbiote sans l’influence récente de ces biotiques, il est recommandé d’interrompre leur prise 1 à 2 semaines avant le prélèvement.
En revanche, si votre objectif est d’évaluer leurs effets sur le microbiote, vous pouvez continuer leur utilisation.
Les aliments riches en probiotiques (yaourt, kefir, choucroute, kimchi, kombucha, etc.), peuvent aussi modifier la composition microbienne, il est préférable d’éviter de les consommer les jours précédant le prélèvement.

Changements alimentaires drastiques

Évitez de changer radicalement votre alimentation juste avant le test : régime très “nettoyant”, jeûne prolongé,… Il est conseillé de maintenir votre régime habituel, même spécifique (régime faible en FODMAP, cétogène,…) pendant au moins une semaine avant le prélèvement.
Si vous venez de déménager, que vous revenez d’un voyage à l’étranger, ou que vous avez modifié vos habitudes alimentaires récemment, cela peut perturber votre microbiote et rendre l’échantillon moins représentatif.

Ce qu’il faut faire (bons réflexes) avant le test

Maintenir vos habitudes (dans la mesure du possible)

Conservez vos habitudes alimentaires et veillez à boire suffisamment d’eau : une bonne hydratation favorise le transit et facilite le prélèvement.
Continuez vos médicaments ou suppléments si nécessaires, n’interrompez jamais un traitement régulier sans avis médical.

Suivre vos symptômes et votre alimentation

Il peut être utile de noter votre alimentation, vos symptômes digestifs et vos activités pendant les 1 à 2 semaines précédant le test. Ces informations facilitent l’interprétation des résultats et permettent de mettre en relation certaines habitudes avec votre profil microbien.

La qualité du prélèvement conditionne directement la qualité de l’analyse. Une bonne préparation permet d’obtenir une image fidèle de votre microbiote, sans biais liés à l’alimentation, aux compléments ou aux traitements récents

Respecter le protocole du test

Le respect des instructions de prélèvement est essentiel pour garantir la conformité de l’échantillon et, par conséquent, la fiabilité des résultats.
Lisez attentivement les instructions indiquées dans le kit : utilisation du tube, du collecteur de selles (“feces catcher”), emballage, temps d’envoi, etc. Nahibu fournit tout le matériel nécessaire et des consignes précises dans son kit de test du microbiote intestinal.
Choisissez un moment calme, quand vous êtes détendu, pour réaliser le prélèvement. Un environnement serein réduit les risques d’erreur et de contamination.
Emballez correctement l’échantillon dans les éléments fournis (shuttle pouch, enveloppe prépayée, etc.) afin d’assurer sa sécurité et sa stabilité durant l’envoi.
Le tube fourni dans le kit Nahibu contient un stabilisateur d’ADN qui permet la conservation de l’échantillon à température ambiante jusqu’à réception dans notre laboratoire. Il est impératif de ne pas vider le tube.

À quel moment reporter votre test ?

Voici quelques situations dans lesquelles il est préférable de ne pas faire le prélèvement immédiatement, et de reporter :

• Vous avez une infection intestinale aiguë, des diarrhées ou des symptômes digestifs marqués
• Vous venez de suivre un traitement médicamenteux : attendre suffisamment (ex. 4–6 semaines pour des antibiotiques) pour laisser votre microbiote se reconstituer.
• Vous avez subi une coloscopie
• Vous avez récemment modifié fortement votre régime alimentaire (nouveau régime, jeûne, supplémentation…) : il vaut mieux revenir à votre “régime normal” pendant quelques jours pour que l’échantillon soit représentatif.
• Vous venez de voyager, surtout à l’étranger, ou de subir d’importants changements de routine : votre microbiote pourrait être “hors de ses habitudes.

Spécificités pour le kit Nahibu

Le kit d’analyse du microbiote intestinal Nahibu est conçu pour un prélèvement à domicile et inclut notamment un collecteur de selles (“feces catcher”), un tube avec stabilisateur d’ADN et une enveloppe prépayée pour l’envoi.
Nahibu utilise le séquençage métagénomique shotgun, qui permet une analyse très fine de votre microbiote. Pour garantir la fiabilité des résultats, il est essentiel que l’échantillon soit de bonne qualité.
Si vous suivez des traitements ou prenez des suppléments, il peut être utile de consulter un professionnel ou de contacter l’équipe Nahibu pour savoir si des ajustements sont nécessaires avant le test. Vous pourrez ensuite renseigner ces informations dans le questionnaire en ligne.

FAQ

Dois-je arrêter les probiotiques avant mon test ?

Oui, généralement 1 à 2 semaines avant de réaliser le test, mais cela dépend du protocole. Certains laboratoires demandent un arrêt, d’autres tolèrent une prise régulière si elle fait partie de votre routine.

Combien de temps attendre après des antibiotiques pour faire le test ?

Il est généralement recommandé d’attendre 4 à 6 semaines après votre dernier antibiotique, afin que votre microbiote ait le temps de se rétablir.

Puis-je faire le test si je voyage ou change souvent de régime ?

Il est préférable de reporter le test si vous venez de changer vos habitudes alimentaires, de rentrer de voyage ou si votre routine a fortement varié : ces perturbations peuvent rendre l’échantillon moins représentatif.

Comment garantir que mon échantillon ne soit pas contaminé ?

Utilisez les éléments fournis dans le kit, suivez scrupuleusement les instructions (ne laissez pas le tube toucher l’eau des toilettes, emballez bien l’échantillon), et renvoyez-le rapidement selon les consignes.

Est-ce que mes médicaments habituels peuvent fausser le test ?

Certains médicaments (anti-inflammatoires, laxatifs, etc.) peuvent influencer le microbiote ou le prélèvement. Vérifiez les instructions du kit et demandez, si besoin, conseil à un professionnel ou à l’équipe Nahibu.

Conclusion :

Bien se préparer est une étape essentielle pour obtenir une analyse du microbiote fiable et utile. En évitant les interférences comme les antibiotiques, les probiotiques ou les changements alimentaires drastiques, et en respectant le protocole du kit (collecte, emballage, envoi), vous assurez la qualité de votre échantillon.
Grâce au test du microbiote intestinal Nahibu, avec son kit de prélèvement à domicile et son analyse basée sur la technologie de séquençage métagénomique shotgun, vous bénéficiez d’une analyse précise et complète. 📊
Agissez maintenant : préparez votre prélèvement avec soin, envoyez votre échantillon, puis utilisez votre rapport pour mieux comprendre votre microbiote et bénéficier des recommandations nutritionnelles personnalisées de Nahibu.

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