Qu’est-ce que le microbiote intestinal ?
Qu’est-ce que le microbiote ?
Définition générale du microbiote
Le microbiote est un ensemble de micro-organismes (virus, bactéries, archées, champignons) vivant dans un environnement spécifique. Il existe différents microbiotes dans le corps humain : cutané, vaginal, intestinal, pulmonaire etc.
Définition générale du microbiote intestinal
Le microbiote intestinal, ou la flore intestinale, représente les micro-organismes qui se trouvent au niveau du tractus digestif : estomac et intestin. C’est le microbiote le plus important en termes de population, il rassemble 1014 (10 000 milliards) micro-organismes, donc 10 fois plus que le nombre de cellules dans l’organisme, et pèse 2 kilogrammes.
Qu’est-ce que le microbiote intestinal ?
Quelle est la composition du microbiote intestinal ?
Le microbiote digestif est composé à 90 % de bactéries. La composition du microbiote varie selon les individus, toutefois, 4 phyla (ou groupes bactériens) se retrouvent systématiquement chez tous les individus : Firmicutes, Bacteroidetes, Proteobacteria et Actinobacteria. Ils constituent le noyau commun.
Comment se développe le microbiote intestinal ?
Le développement du microbiote au cours de la vie
Le microbiote intestinal se développe à la naissance. Dès son développement et au cours de la vie de l’individu, il est influencé par plusieurs facteurs qui vont perturber sa composition bactérienne. Tout d’abord, à la naissance, la composition dépend du mode d’accouchement du nouveau-né, c’est-à-dire si l’accouchement a lieu par voie basse ou par césarienne, et de l’âge gestationnel. Lors d’une naissance classique, le nouveau-né est en contact avec le microbiote vaginal de la mère.
Ainsi, ce sont ces bactéries qui sont les premières à coloniser le tube digestif du nouveau-né. Tandis que, lors d’une naissance assistée, le nouveau-né est d’abord en contact avec le microbiote cutané et n’est donc jamais en relation avec les bactéries vaginales. Ensuite, des différences apparaissent selon le régime alimentaire du nouveau-né, s’il est nourri au lait maternel ou au lait artificiel.
Cette disparité entraîne des différences dans la composition bactérienne. Le sevrage marque également un changement dans la composition bactérienne du microbiote intestinal. De la naissance au sevrage, c’est-à-dire le plus souvent vers l’âge de 2,5 ans, le microbiote digestif est très instable donc très vulnérable.
Les facteurs qui influencent le microbiote intestinal
On considère qu’après 2,5 ans, le microbiote devient stable et similaire à celui d’un adulte, cependant, il continue à évoluer tout au long de la vie s’il est exposé à certains facteurs tels que : la prise d’antibiotiques, les maladies, le stress, le régime alimentaire, la zone géographique, le niveau de santé etc.
Par exemple, la prise d’antibiotiques réduit considérablement la diversité bactérienne du microbiote et entraîne une diminution des mécanismes de défense qui protègent l’organisme contre les agents pathogènes.
L’altération de la flore intestinale, plus communément appelée la dysbiose, est associée à des pathologies comme les maladies neurodégénératives (Alzheimer, Parkinson…), les maladies métaboliques (diabète, obésité…), les cancers, les allergies etc. La dysbiose se traduit par un déséquilibre du microbiote intestinal et résulte d’une réduction de la diversité bactérienne, au profit d’espèces pathogènes.
Quels sont les rôles du microbiote intestinal ?
Le microbiote intestinal remplit un certain nombre de fonctions vitales dans le corps humain. Tout d’abord, il joue un rôle dans la protection de l’organisme en le défendant contre les agents pathogènes. Il est également impliqué dans les fonctions métaboliques ; il permet l’absorption et la production de nutriments. Enfin, il joue un rôle clé dans le système immunitaire.
Il existe donc une réelle symbiose entre les micro-organismes du microbiote intestinal et l’hôte, garantissant une bonne santé ; l’hôte et la flore intestinale ne pouvant évoluer l’un sans l’autre.
Comment peut-on analyser son microbiote ?
Aujourd’hui, on peut analyser les gènes présents dans les bactéries d’un échantillon de selles pour connaître la composition de son microbiote intestinal. L’analyse métagénomique, qui regroupe l’ensemble des génomes bactériens, permet alors de connaître la richesse bactérienne, l’entérotype de l’individu, l’équilibre de la flore intestinale, la répartition des phyla (ou groupes bactériens), la production d’acides gras à chaîne courte, etc…
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